APOL2 - APOL2

APOL2
Идентификаторы
Псевдонимы	APOL2, APOL-II, APOL3, аполипопротеин L2
Внешние идентификаторы	OMIM: 607252 MGI: 2444921 ГомолоГен: 12785 Генные карты: APOL2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 22 (человек)
Конец	36,239,954 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 15 (мышь)
Конец	77,757,003 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• рецепторное связывание; • связывание липидов; • связывание липопротеинов высокой плотности с частицами;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • внеклеточная область; • мембрана эндоплазматического ретикулума; • мембрана;
Биологический процесс	• развитие многоклеточного организма; • липопротеиновый метаболический процесс; • липидный транспорт; • метаболический процесс холестерина; • острофазовый ответ; • материнский процесс, связанный с беременностью женщины; • липидный обмен; • транспорт;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	23780
	239552
	ENSG00000128335
	ENSMUSG00000056656
	Q9BQE5
	н / д
	NM_030882; NM_145637
	NM_001081970; NM_001357895; NM_001357896
	NP_112092; NP_663612
	н / д
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Аполипопротеин L2 это белок что у людей кодируется APOL2 ген.^[5]^[6]^[7]

Этот ген является членом аполипопротеин L генная семья и белок в этом семействе находятся липид-связывающие белки. Этот ген кодирует белок 37,1 кДа, а последовательность белка содержит 337 пар оснований. Локализация этого белка в основном обнаруживается в цитозоль, нуклеоплазма кроме того, это также видно на Ядерные тела.^[8] Участие этого гена может влиять на движение липидов и связывание липидов с органеллами. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.^[7]

Белковая последовательность

> sp | Q9BQE5 | 1-337

MNPESSIFIEDYLKYFQDQVSRENLLQLLTDDEAWNGFVAAAELPRDEADELRKALNKLA

SHMVMKDKNRHDKDQQHRQWFLKEFPRLKRELEDHIRKLRALAEEVEQVHRGTTIANVVS

NSVGTTSGILTLLGLGLAPFTEGISFVLLDTGMGLGAAAAVAGITCSVVELVNKLRARAQ

ARNLDQSGTNVAKVMKEFVGGNTPNVLTLVDNWYQVTQGIGRNIRAIRRARANPQLGAYA

PPPHIIGRISAEGGEQVERVVEGPAQAMSRGTMIVGAATGGILLLLDVVSLAYESKHLLE

GAKSESAEELKKRAQELEGKLNFLTKIHEMLQPGQDQ

Взаимодействия

APOL2 был показан взаимодействовать с:

IFN-γ,^[9]

CD81,^[10]

TNF-α,^[11]

Bcl-2,^[12]

Варианты соединения

ApoL2 имеет 5 вариантов сварки,^[13]

APOL2-001

Этот транскрипт имеет 6 экзонов, 12 доменов и функций аннотированы, 263 варианта связаны с этим и соответствуют 35 олигозондам.

APOL2-002

Этот транскрипт имеет 5 экзонов, 12 доменов и функций аннотированы, 263 варианта связаны с этим геном и соответствуют 37 олигозондам.

APOL2-006

Этот транскрипт имеет 6 экзонов, аннотирован 3 доменами и признаками, 62 вариации связаны с этим геном и соответствуют 20 олигозондам.

APOL2-008

Этот транскрипт имеет 6 экзонов, 12 доменов и функций аннотированы, 331 вариация связана с этим геном и соответствует 32 олигозондам.

APOL2-009

Этот транскрипт имеет 5 экзонов, 4 домена и характеристики аннотированы, 104 варианта связаны с этим геном и соответствуют 13 олигозондам.

Функции ApoL2

Реакция на острое воспаление ^[14]^[15]
Процесс метаболизма холестерина^[16]
Липидный метаболический процесс^[12]
Материнский процесс, вовлеченный в женскую беременность^[17]
Связывание липидов^[18]
Связывание сигнального рецептора^[18]

внешняя ссылка

Человек APOL2 расположение генома и APOL2 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
Человек АПОЛ3 расположение генома и АПОЛ3 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

МакГи К.А., Моррис Д.В., Швайгер С. (2005). "Исследование семейства генов аполипопротеина-L (APOL) и шизофрении с использованием новой стратегии объединения ДНК для общедоступных баз данных SNP". Schizophr. Res. 76 (2–3): 231–8. Дои:10.1016 / j.schres.2005.01.006. PMID 15949655.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Гроуз Л.Х. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Monajemi H, Fontijn RD, Pannekoek H, Horrevoets AJ (2002). «Кластер генов аполипопротеина L появился недавно в процессе эволюции и экспрессируется в сосудистой ткани человека». Геномика. 79 (4): 539–46. Дои:10.1006 / geno.2002.6729. PMID 11944986.
Duchateau PN, Pullinger CR, Cho MH (2001). «Семейство генов аполипопротеина L: тканеспецифическая экспрессия, сплайсинг, промоторные области; открытие нового гена». J. Lipid Res. 42 (4): 620–30. PMID 11290834.
Адамс, доктор медицины, Керлаваж А.Р., Флейшманн, Р.Д. (1995). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и паттернов экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF). Природа. 377 (6547 Прил.): 3–174. PMID 7566098.

Эта статья о ген на хромосома человека 22 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000128335 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056656 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10591208-5] Данхэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Биэр Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бисли О., Берд С.П., Блейки С., Бриджман А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В.Д., О'Брайен К.П. и др. (Декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID 10591208.

[pmid11374903-6] Пейдж Н.М., Батлин Д.Д., Ломтайсонг К., Лоури П.Дж. (май 2001 г.). «Кластер гена аполипопротеина L человека: идентификация, классификация и места распространения». Геномика. 74 (1): 71–8. Дои:10.1006 / geno.2001.6534. PMID 11374903.

[entrez-7] а ^б "Entrez Gene: APOL2, аполипопротеин L, 2".

[Protein_Location-8] "Ген атласа белков человека: аполипопротеин L, 2 APOL2".

[pmid20665705-9] Ляо В., Го Ф.Й., Беттс Р.Дж., Кемени Д.М., Там Дж., Бэй Б.Х., Вонг В.С. (февраль 2011 г.). «Новая антиапоптотическая роль аполипопротеина L2 в цитотоксичности, вызванной IFN-гамма, в эпителиальных клетках бронхов человека». J Cell Physiol. 226 (2): 397–406. Дои:10.1002 / jcp.22345. PMID 20665705.

[pmid30024968-10] Брюнинг Дж., Лассвиц Л., Бансе П., Каль С., Маринах С., Вондран Ф. В., Кадерали Л., Сильви О, Пичманн Т., Мейснер Ф., Герольд Г. (июль 2018 г.). «Вирус гепатита С проникает в клетки печени с помощью белков рецепторного комплекса CD81 кальпаин-5 и CBLB». Патогены PLOS. 14 (7): 55–67. Дои:10.1371 / journal.ppat.1007111. ЧВК 6053247. PMID 30024968.

[pmid19299565-11] Смит Э. Э., Малик Х. С. (май 2009 г.). «Семейство аполипопротеина L генов запрограммированной клеточной смерти и иммунитета быстро эволюционировало у приматов на дискретных участках взаимодействий хозяин-патоген». Genome Res. 19 (5): 850–8. Дои:10.1101 / гр.085647.108. ЧВК 2675973. PMID 19299565.

[pmid15671246-12] а ^б Лю З., Лу Х., Цзян З., Пастушин А., Ху Калифорния (январь 2005 г.). «Аполипопротеин 16, новый проапоптотический белок, гомологичный только 3 Bcl-2, индуцирует митохондриально-опосредованный апоптоз в раковых клетках». Мол Рак Res. 3 (1): 21–31. PMID 15671246.

[Protein_Information-13] "Ген атласа белков человека: аполипопротеин L, 2 APOL2".

[pmid20702412-14] Рао С.К., Павичевич З., Ду Зи, Ким Дж. Г., Фан М., Цзяо Й., Роузбуш М., Самант С., Гу В., Пфеффер Л. М., Носрат, Калифорния (октябрь 2010 г.). «Провоспалительные гены как биомаркеры и терапевтические мишени при плоскоклеточном раке полости рта». J Biol Chem. 285 (42): 32512–21. Дои:10.1074 / jbc.M110.150490. ЧВК 2952253. PMID 20702412.

[pmid23856606-15] Лю З., Лу Х., Цзян З., Пастушин А., Ху Калифорния (октябрь 2013 г.). «Митохондриальный протеомный анализ человеческих клеток-хозяев, инфицированных вирусом свиного гриппа H3N2». J Proteomics. 8 (91): 136–50. Дои:10.1016 / j.jprot.2013.06.037. PMID 23856606.

[pmid22303337-16] Ван К., Эдмондсон А.С., Ли М., Гао Ф., Касим А.Н., Девани Дж. М., Бернетт М.С., Уотерворт Д.М., Мозер В., Грант С.Ф., Эпштейн С.Е., Рейли М.П., Хаконарсон Х., Рейдер Д.Д. (июль 2011 г.). «Исследование ассоциации с широким путём включает в себя множественные гены транспорта и метаболизма стеролов в регуляции холестерина ЛПВП». Границы генетики. 2 (4): 41. Дои:10.3389 / fgene.2011.00041. ЧВК 3268595. PMID 22303337.

[pmid20008415-17] Бросенс Дж. Дж., Ходжеттс А., Фероз-Заиди Ф, Шервин Дж. Р., Фуси Л., Салкер М. С., Хайэм Дж., Роуз Г. Л., Кадихара Т., Янг С. Л., Лесси Б. А., Генриет П., Лангфорд ПР, Фазлеабас А. Т. (апрель 2010 г.). «Протеомный анализ эндометрия у фертильных и бесплодных пациентов предполагает роль аполипопротеина A-I в неудачной имплантации эмбриона и эндометриозе». MHR: фундаментальная наука репродуктивной медицины. 16 (4): 273–285. Дои:10,1093 / моль · ч / разрыв108. ЧВК 2834406. PMID 20008415.

[Go_Biological_Process-18] а ^б "Nextprot Gene: APOL2, аполипопротеин L, 2".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]