ASIC1 - ASIC1

ASIC1
Идентификаторы
Псевдонимы	ASIC1, ACCN2, ASIC, BNaC2, субъединица 1 кислотно-чувствительного ионного канала
Внешние идентификаторы	OMIM: 602866 MGI: 1194915 ГомолоГен: 121755 Генные карты: ASIC1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 12 (человек)
Конец	50,083,611 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 15 (мышь)
Конец	99,701,130 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность ионно-управляемого канала; • активность натриевых каналов; • активность ионного канала; • GO: 0001948 связывание с белками; • активность катионного канала; • активность лиганд-зависимых натриевых каналов; • активность кислоточувствительного ионного канала;
Сотовый компонент	• неотъемлемый компонент мембраны; • мембрана; • синапс; • неотъемлемый компонент плазматической мембраны; • поверхность клетки; • аппарат Гольджи; • клеточная мембрана;
Биологический процесс	• отрицательная регуляция секреции нейромедиаторов; • ассоциативное обучение; • трансмембранный транспорт ионов натрия; • транспорт ионов натрия; • регулирование мембранного потенциала; • катионный транспорт; • объем памяти; • сенсорное восприятие кислого вкуса; • ионный транспорт; • гомотримеризация белков; • трансмембранный перенос ионов; • клеточный ответ на pH; • трансмембранный транспорт ионов кальция; • реакция на pH; • преобразование сигнала; • реакция на кислый pH; • транспорт ионов кальция; • поведенческая реакция страха; • ответ на амфетамин;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	41
	11419
	ENSG00000110881
	ENSMUSG00000023017
	P78348
	Q6NXK8
	NM_001095; NM_001256830; NM_020039
	NM_001289791; NM_009597
	NP_001086; NP_001243759; NP_064423
	NP_001276720; NP_033727
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Кислоточувствительный ионный канал 1 (ASIC1) также известен как амилорид-чувствительный катионный канал 2, нейрональный (ACCN2) или мозговой натриевый канал 2 (BNaC2) - это белок что у людей кодируется ASIC1 ген. Ген ASIC1 - один из пяти паралогичный гены, кодирующие белки, образующие тримерный кислоточувствительные ионные каналы (ASIC) у млекопитающих.^[5] КДНК этого гена была впервые клонирована в 1996 году.^[6] У генов ASIC есть варианты сплайсинга, которые кодируют различные белки, которые называются изоформами.

Эти гены в основном экспрессируются в центральной и периферической нервной системе.

ASIC могут образовывать как гомотримерные (то есть состоящие из трех идентичных субъединиц), так и гетеротримерные каналы.^[7]^[8]

Структура и функции

Этот ген кодирует член ASIC /ENaC надсемейство белков.^[9] Члены этой семьи амилорид -чувствительный натрий каналы, содержащие внутриклеточный N и C конец, 2 гидрофобный трансмембранный (TM) регионов, и большой внеклеточный петля, в которой много цистеин остатки с сохраненным интервалом. Области TM обычно обозначаются символами TM1 (клон до N-конца) и TM2 (рядом с C-концом).

Пора канала, через который ионы селективно протекают с внеклеточной стороны в цитоплазму, образована тремя участками TM2 тримера.^[5]

Взаимодействия

ASIC1 был показан взаимодействовать с участием PICK1.^[10]^[11]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000110881 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023017 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б Ханукоглу I (2017). «Натриевые каналы типа ASIC и ENaC: конформационные состояния и структура фильтров ионной селективности». Журнал FEBS. 284 (4): 525–545. Дои:10.1111 / фев.13840. PMID 27580245. S2CID 24402104.
^ Гарсия-Аньоверос Дж., Дерфлер Б., Невилл-Голден Дж., Хайман Б.Т., Кори Д.П. (март 1997 г.). «BNaC1 и BNaC2 составляют новое семейство нейронных натриевых каналов человека, связанных с дегенеринами и эпителиальными натриевыми каналами». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (4): 1459–64. Bibcode:1997PNAS ... 94.1459G. Дои:10.1073 / пнас.94.4.1459. ЧВК 19813. PMID 9037075.
^ Бабински К., Катарси С., Бьяджини Дж., Сегела П. (сентябрь 2000 г.). «Субъединицы ASIC2a и ASIC3 млекопитающих совместно собираются в гетеромерные протонно-управляемые каналы, чувствительные к Gd3 +». Журнал биологической химии. 275 (37): 28519–25. Дои:10.1074 / jbc.M004114200. PMID 10842183.
^ Bassilana F, Champigny G, Waldmann R, de Weille JR, Heurteaux C, Lazdunski M (ноябрь 1997 г.). «Чувствительная к кислоте субъединица ионного канала ASIC и дегенерин млекопитающих MDEG образуют гетеромультимерный H + -зависимый Na + канал с новыми свойствами». Журнал биологической химии. 272 (46): 28819–22. Дои:10.1074 / jbc.272.46.28819. PMID 9360943.
^ Ханукоглу И., Ханукоглу А. (январь 2016 г.). «Семейство эпителиальных натриевых каналов (ENaC): филогения, структура-функция, распределение тканей и связанные наследственные заболевания». Ген. 579 (2): 95–132. Дои:10.1016 / j.gene.2015.12.061. ЧВК 4756657. PMID 26772908.
^ Леонард А.С., Ермолаева О., Хруска-Хагеман А., Асквит С.К., Прайс М.П., Wemmie JA, Welsh MJ (февраль 2003 г.). «цАМФ-зависимое фосфорилирование протеинкиназы кислоточувствительного ионного канала-1 регулирует его связывание с белком, взаимодействующим с С-киназой-1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (4): 2029–34. Bibcode:2003ПНАС..100.2029Л. Дои:10.1073 / pnas.252782799. ЧВК 149953. PMID 12578970.
^ Hruska-Hageman AM, Wemmie JA, Price MP, Welsh MJ (февраль 2002 г.). «Взаимодействие синаптического белка PICK1 (белок, взаимодействующий с C-киназой 1) с натриевыми каналами, не управляемыми напряжением, BNC1 (мозговой Na + канал 1) и ASIC (кислоточувствительный ионный канал)». Biochem. J. 361 (Pt 3): 443–50. Дои:10.1042/0264-6021:3610443. ЧВК 1222326. PMID 11802773.

дальнейшее чтение

Кори Д.П., Гарсия-Аньоверос Дж. (1996). «Механочувствительность и ионные каналы DEG / ENaC». Наука. 273 (5273): 323–4. Bibcode:1996Наука ... 273..323C. Дои:10.1126 / science.273.5273.323. PMID 8685718. S2CID 9015840.
Waldmann R, Champigny G, Bassilana F, Heurteaux C, Lazdunski M (1997). «Управляемый протонами катионный канал, участвующий в восприятии кислоты». Природа. 386 (6621): 173–7. Bibcode:1997 Натур.386..173Вт. Дои:10.1038 / 386173a0. PMID 9062189. S2CID 4361943.
Бубьен Дж. К., Китон Д. А., Фуллер К. М., Гиллеспи Г. Ю., Редди А. Т., Mapstone TB, Бенос Д. Д. (1999). «Злокачественные глиомы человека выражают чувствительную к амилориду Na + проводимость». Am. J. Physiol. 276 (6 Pt 1): C1405–10. Дои:10.1152 / ajpcell.1999.276.6.C1405. PMID 10362604.
Askwith CC, Cheng C, Ikuma M, Benson C, Price MP, Welsh MJ (2000). «Нейропептид FF и FMRFамид усиливают вызванные кислотой токи от сенсорных нейронов и протонно-управляемых каналов DEG / ENaC». Нейрон. 26 (1): 133–41. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81144-7. PMID 10798398. S2CID 14077330.
Бесслер Э.Л., Нго-Ань Т.Дж., Гейслер Х.С., Рупперсберг Дж. П., Грюндер С. (2001). «Молекулярная и функциональная характеристика кислоточувствительного ионного канала (ASIC) 1b». J. Biol. Chem. 276 (36): 33782–7. Дои:10.1074 / jbc.M104030200. PMID 11448963.
Гунторп MJ, Смит GD, Дэвис JB, Рэндалл AD (2001). «Характеристика человеческого кислотно-чувствительного ионного канала (hASIC1a), эндогенно экспрессируемого в клетках HEK293». Арка Пфлюгерса. 442 (5): 668–74. Дои:10.1007 / s004240100584. PMID 11512022. S2CID 19059975.
Дугган А, Гарсия-Ановерос Дж, Кори Д.П. (2002). «Белок PICK1 домена PDZ и натриевой канал BNaC1 взаимодействуют и локализуются на механосенсорных терминалах нейронов ганглия дорзального корешка и дендритах центральных нейронов». J. Biol. Chem. 277 (7): 5203–8. Дои:10.1074 / jbc.M104748200. PMID 11739374.
Джи Х.Л., Джовов Б., Фу Дж., Бишоп Л.Р., Мебане Х.С., Фуллер С.М., Стэнтон Б.А., Бенос Д.Д. (2002). «Повышение регуляции кислотно-управляемых Na (+) каналов (ASIC) с помощью коэкспрессии регулятора трансмембранной проводимости при муковисцидозе в ооцитах Xenopus». J. Biol. Chem. 277 (10): 8395–405. Дои:10.1074 / jbc.M109465200. PMID 11748227.
Hruska-Hageman AM, Wemmie JA, Price MP, Welsh MJ (2002). «Взаимодействие синаптического белка PICK1 (белок, взаимодействующий с C-киназой 1) с натриевыми каналами, не управляемыми напряжением, BNC1 (мозговой Na + канал 1) и ASIC (кислоточувствительный ионный канал)». Biochem. J. 361 (Pt 3): 443–50. Дои:10.1042/0264-6021:3610443. ЧВК 1222326. PMID 11802773.
Wemmie JA, Chen J, Askwith CC, Hruska-Hageman AM, Price MP, Nolan BC, Yoder PG, Lamani E, Hoshi T., Freeman JH, Welsh MJ (2002). «Активированный кислотой ионный канал ASIC способствует синаптической пластичности, обучению и памяти». Нейрон. 34 (3): 463–77. Дои:10.1016 / S0896-6273 (02) 00661-X. PMID 11988176. S2CID 2619519.
Бердиев BK, Xia J, Jovov B, Markert JM, Mapstone TB, Gillespie GY, Fuller CM, Bubien JK, Benos DJ (2003). «Антагонизм изоформы протеинкиназы C контролирует функцию BNaC2 (ASIC1)». J. Biol. Chem. 277 (48): 45734–40. Дои:10.1074 / jbc.M208995200. PMID 12244121.
Угава С., Уэда Т., Исида Ю., Нишигаки М., Шибата Ю., Шимада С. (2002). «Кислоточувствительные ионные каналы, блокируемые амилоридом, являются ведущими кислотными сенсорами, экспрессируемыми в ноцицепторах человека». J. Clin. Вкладывать деньги. 110 (8): 1185–90. Дои:10.1172 / JCI15709. ЧВК 150796. PMID 12393854.
Леонард А.С., Ермолаева О., Хруска-Хагеман А., Асквит С.К., Прайс М.П., Wemmie JA, Welsh MJ (2003). «цАМФ-зависимое фосфорилирование протеинкиназы кислоточувствительного ионного канала-1 регулирует его связывание с белком, взаимодействующим с С-киназой-1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (4): 2029–34. Bibcode:2003ПНАС..100.2029Л. Дои:10.1073 / pnas.252782799. ЧВК 149953. PMID 12578970.
Wemmie JA, Coryell MW, Askwith CC, Lamani E, Leonard AS, Sigmund CD, Welsh MJ (2004). «Избыточная экспрессия чувствительного к кислоте ионного канала 1a у трансгенных мышей увеличивает приобретенное поведение, связанное со страхом». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (10): 3621–6. Bibcode:2004PNAS..101.3621W. Дои:10.1073 / pnas.0308753101. ЧВК 373512. PMID 14988500.
Пуаро О., Вукичевич М., Бош А., Келленбергер С. (2004). «Селективная регуляция кислоточувствительного ионного канала 1 сериновыми протеазами». J. Biol. Chem. 279 (37): 38448–57. Дои:10.1074 / jbc.M407381200. PMID 15247234.
Прайс М. П., Томпсон Р. Дж., Эшкол Дж. О., Вемми Дж. А., Бенсон С. Дж. (2005). «Стоматин модулирует закрытие ионных каналов, чувствительных к кислоте». J. Biol. Chem. 279 (51): 53886–91. Дои:10.1074 / jbc.M407708200. PMID 15471860.

внешние ссылки

Человек ASIC1 расположение генома и ASIC1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья о ген на хромосома человека 12 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000110881 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023017 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[2017-Hanukoglu-5] а ^б Ханукоглу I (2017). «Натриевые каналы типа ASIC и ENaC: конформационные состояния и структура фильтров ионной селективности». Журнал FEBS. 284 (4): 525–545. Дои:10.1111 / фев.13840. PMID 27580245. S2CID 24402104.

[pmid9037075-6] Гарсия-Аньоверос Дж., Дерфлер Б., Невилл-Голден Дж., Хайман Б.Т., Кори Д.П. (март 1997 г.). «BNaC1 и BNaC2 составляют новое семейство нейронных натриевых каналов человека, связанных с дегенеринами и эпителиальными натриевыми каналами». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (4): 1459–64. Bibcode:1997PNAS ... 94.1459G. Дои:10.1073 / пнас.94.4.1459. ЧВК 19813. PMID 9037075.

[7] Бабински К., Катарси С., Бьяджини Дж., Сегела П. (сентябрь 2000 г.). «Субъединицы ASIC2a и ASIC3 млекопитающих совместно собираются в гетеромерные протонно-управляемые каналы, чувствительные к Gd3 +». Журнал биологической химии. 275 (37): 28519–25. Дои:10.1074 / jbc.M004114200. PMID 10842183.

[8] Bassilana F, Champigny G, Waldmann R, de Weille JR, Heurteaux C, Lazdunski M (ноябрь 1997 г.). «Чувствительная к кислоте субъединица ионного канала ASIC и дегенерин млекопитающих MDEG образуют гетеромультимерный H + -зависимый Na + канал с новыми свойствами». Журнал биологической химии. 272 (46): 28819–22. Дои:10.1074 / jbc.272.46.28819. PMID 9360943.

[2016-Hanukoglu-9] Ханукоглу И., Ханукоглу А. (январь 2016 г.). «Семейство эпителиальных натриевых каналов (ENaC): филогения, структура-функция, распределение тканей и связанные наследственные заболевания». Ген. 579 (2): 95–132. Дои:10.1016 / j.gene.2015.12.061. ЧВК 4756657. PMID 26772908.

[pmid12578970-10] Леонард А.С., Ермолаева О., Хруска-Хагеман А., Асквит С.К., Прайс М.П., Wemmie JA, Welsh MJ (февраль 2003 г.). «цАМФ-зависимое фосфорилирование протеинкиназы кислоточувствительного ионного канала-1 регулирует его связывание с белком, взаимодействующим с С-киназой-1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (4): 2029–34. Bibcode:2003ПНАС..100.2029Л. Дои:10.1073 / pnas.252782799. ЧВК 149953. PMID 12578970.

[pmid11802773-11] Hruska-Hageman AM, Wemmie JA, Price MP, Welsh MJ (февраль 2002 г.). «Взаимодействие синаптического белка PICK1 (белок, взаимодействующий с C-киназой 1) с натриевыми каналами, не управляемыми напряжением, BNC1 (мозговой Na + канал 1) и ASIC (кислоточувствительный ионный канал)». Biochem. J. 361 (Pt 3): 443–50. Дои:10.1042/0264-6021:3610443. ЧВК 1222326. PMID 11802773.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]