C2CD4D - C2CD4D - Wikipedia

C2CD4D
Идентификаторы
ПсевдонимыC2CD4D, FAM148D, кальций-зависимый домен C2, содержащий 4D, кальций-зависимый домен C2, содержащий 4D
Внешние идентификаторыMGI: 2685505 ГомолоГен: 86310 Генные карты: C2CD4D
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение C2CD4D
Геномное расположение C2CD4D
Группа1q21.3Начинать151,837,819 бп[1]
Конец151,840,557 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001136003

NM_001136117

RefSeq (белок)

NP_001129475

NP_001129589

Расположение (UCSC)Chr 1: 151,84 - 151,84 МбChr 3: 94.36 - 94.36 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

C2CD4D, или же C2 кальций-зависимый домен, содержащий белок 4D белковый продукт человеческий геном. Ген, кодирующий этот белок, находится на хромосоме 1, от 150 076 963 до 150 079 657. Ген содержит 2 экзоны и кодирует 353 аминокислоты. Синонимы слова C2CD4D: «FAM148D».[5] и NP_001129475. C2CD4D содержит консервативный металл-связывающий домен, известный как Консервативная область 2 протеинкиназы C, подгруппа 1. Этот мотив, как известно, является членом суперсемейства C2, которое присутствует в фосфолипазы, протеинкиназы C и синаптотагмины.[6] Аминокислотная последовательность C2CD4D доступна по адресу [1] До любой посттрансляционной модификации C2CD4D имел молекулярную массу 37,6 кДал.[7] Хотя ученые еще не определили, где C2CD4D функционирует в клетке, C2CD4D предсказал изоэлектрическая точка 11.636, что сильно ограничивает области, в которых он может быть эффективным. Кроме того, C2CD4D не содержит никаких предсказанных трансмембранных доменов или каких-либо предсказанных сигнальных пептидов.

Выражение

Согласно Национальный центр биотехнологической информации, C2CD4D экспрессируется только у взрослых людей с некоторой формой рак.[8] C2CD4D не экспрессируется повсеместно, и до сих пор ученые обнаружили, что C2CD4D экспрессируется только в тканях мозга, кишечника и молочной железы.

Эволюционное сохранение

Известно 52 ортолога C2CD4D у млекопитающих,[9] встречается как минимум у 10 видов, включая Пан троглодиты, Орниторинчус анатинус, и Sus scrofa. Всего у этих 10 видов имеется 38 полностью консервативных остатков, что соответствует 10,76% сохранности. У позвоночных сохранность остается высокой и составляет 33 остатка, что соответствует 9,3%. Однако, за исключением позвоночных, сохранность снижается максимум до 1,98%, или до 3 остатков.[10]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000225556 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000091648 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «C2 кальций-зависимый домен, содержащий белок 4D [Homo sapiens] - белок - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov.
  6. ^ NCBI https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=119477
  7. ^ Верстак, NCSA Biology. "SDSC Biology Workbench". workbench.sdsc.edu.
  8. ^ Национальный центр биотехнологической информации
  9. ^ "NCBI Blast:". blast.ncbi.nlm.nih.gov.
  10. ^ данные выравнивания, определенные с помощью инструмента ClustalW, доступного на http://workbench.sdsc.edu и соответствующие результаты ортологов, полученные в результате быстрого поиска с помощью инструмента, доступного на http://blast.ncbi.nlm.nih.gov