5 'UTR мРНК CspA - CspA mRNA 5′ UTR
| cspA 5 'UTR | |
|---|---|
 Консервированная вторичная структура 5 'UTR РНК cspA | |
| Идентификаторы | |
| Символ | cspA 5'UTR |
| Рфам | RF01766 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | Снг; Терморегулятор; |
| Домен (ы) | Энтеробактерии |
| PDB структуры | PDBe |
мРНК cspA 5 'UTR это непереведенный регион из cspA ген, что важно в холодный шок ответ в Энтеробактерии Такие как Кишечная палочка. Элемент 5 'UTR действует как Термометр РНК, регулирующий выражение из cspA в ответ на температуру.[1] Регулируя температуру, белки cspA выполняют жизненно важную функцию гомеостаз.
Впервые подозрение на значимость 5 'UTR возникло, когда мутации в этом регионе cspA значительно повысила стабильность транскрипта при 37 ° С.[2]
Вторичная структура cspA мРНК изменения в ответ на температуру; при 37 ° C расшифровка нестабильна и менее эффективна переведено чем при более низких температурах.[3] В отличие от других термометров РНК (например, FourU ) вторичная структура не зависит от плавления заколка для волос чтобы повлиять экспрессия гена. Вместо этого при температуре ниже 20 ° C цис-регуляторный область нкРНК в 5 'UTR cspA представляет Последовательность Шайна-Далгарно и AUG стартовый кодон к рибосома более доступным способом. Точный механизм изменения конформации мРНК неизвестен.[1] Затем белок cspA вырабатывается в значительно более высоких количествах, составляя более 2% клеточного протеом во время холодового шока.[4] белок cspA связывает Hfq, что стимулирует производство сигма факторы которые опосредуют реакцию на стресс.[5]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б Джулиодори А.М., Ди Пьетро Ф., Марци С. и др. (Январь 2010 г.). «МРНК cspA представляет собой термодатчик, который модулирует трансляцию белка холодового шока CspA». Мол. Клетка. 37 (1): 21–33. Дои:10.1016 / j.molcel.2009.11.033. PMID 20129052.
- ^ Яманака К., Митта М., Иноуэ М. (октябрь 1999 г.). «Мутационный анализ 5'-нетранслируемой области мРНК cspA холодового шока Escherichia coli». J. Bacteriol. 181 (20): 6284–6291. ЧВК 103761. PMID 10515916. Получено 2010-07-23.
- ^ Breaker RR (январь 2010 г.). «РНК отключается на морозе». Мол. Клетка. 37 (1): 1–2. Дои:10.1016 / j.molcel.2009.12.032. ЧВК 5315359. PMID 20129048.
- ^ Brandi A, Spurio R, Gualerzi CO, Pon CL (март 1999 г.). «Массивное присутствие основного белка холодового шока» Escherichia coli CspA в нестрессовых условиях ». EMBO J. 18 (6): 1653–1659. Дои:10.1093 / emboj / 18.6.1653. ЧВК 1171252. PMID 10075935.
- ^ Хэнкинс Дж. С., Денроч Х, Маки Г. А. (май 2010 г.). «Взаимодействие РНК-связывающего белка Hfq с мРНК cspA, кодирующей основной белок холодового шока». J. Bacteriol. 192 (10): 2482–2490. Дои:10.1128 / JB.01619-09. ЧВК 2863566. PMID 20233932. Получено 2010-07-23.
дальнейшее чтение
- Гольдштейн Дж., Поллитт Н.С., Иноуе М. (январь 1990 г.). «Главный белок холодового шока Escherichia coli». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (1): 283–287. Bibcode:1990PNAS ... 87..283G. Дои:10.1073 / pnas.87.1.283. ЧВК 53247. PMID 2404279. Получено 2010-07-23.
- Gualerzi CO, Giuliodori AM, Pon CL (август 2003 г.). «Транскрипционный и посттранскрипционный контроль генов холодового шока». J. Mol. Биол. 331 (3): 527–539. Дои:10.1016 / S0022-2836 (03) 00732-0. PMID 12899826.
- Narberhaus F, Waldminghaus T, Chowdhury S (январь 2006 г.). «Термометры РНК». FEMS Microbiol. Rev. 30 (1): 3–16. Дои:10.1111 / j.1574-6976.2005.004.x. PMID 16438677. Архивировано из оригинал на 2013-01-05. Получено 2010-07-23.
- De La Fuente, M .; Валера, С .; Мартинес-Гитарте, Х. Л. (2012). «NcRNAs и терморегуляция: взгляд на прокариот и эукариот». Письма FEBS. 586 (23): 4061–4069. Дои:10.1016 / j.febslet.2012.10.018. PMID 23098758.