Циано-2 РНК-мотив - Cyano-2 RNA motif

Циано-2 РНК-мотив
Циано-2-РНК.svg
Консенсусная вторичная структура циано-2 РНК
Идентификаторы
СимволЦиано-2
РфамRF01702
Прочие данные
РНК типмРНК
Домен (ы)Синехококк
PDB структурыPDBe

В Циано-2 РНК-мотив консервированный РНК структура идентифицирована биоинформатика.[1] Циано-2 РНК находятся в Цианобактерии виды, классифицированные в род Синехококк. Многие концевые петли в двух консервативных стебель-петли содержат нуклеотидную последовательность GCGA, и эти последовательности могут в некоторых случаях образовывать стабильную GNRA тетрапетля. Поскольку две стебли-петли находятся на некотором расстоянии друг от друга, возможно, что они представляют собой два независимых некодирующие РНК которые часто или всегда совпадаютзаписано. Область тысяча пар оснований перед предсказанными РНК Cyano-2 обычно лишены аннотированных функций, таких как РНК или белок -кодирование гены. Отсутствие аннотированных генов в пределах одной тысячи пар оснований относительно необычно для бактерии.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК  2864571. PMID  20230605.

внешняя ссылка