Эндогликозидаза H - Endoglycosidase H

Маннозил-гликопротеин эндо-бета-N-ацетилглюкозаминидаза
Идентификаторы
Номер ЕС3.2.1.96
Количество CAS37278-88-9
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum

Фермент Эндогликозидаза H (EC 3.2.1.96, Эндо-β-N-ацетилглюкозаминидаза H, N, N'-диацетилхитобиозил бета-N-ацетилглюкозаминидаза, маннозил-гликопротеин эндо-бета-N-ацетилглюкозамидаза, ди-N-ацетилхитобиозил бета-N-ацетилглюкозаминидаза, эндо-бета-ацетилглюкозаминидаза, эндо-бета- (1-> 4) -N-ацетилглюкозаминидаза, маннозил-гликопротеин 1,4-N-ацетамидодезокси-бета-D-гликогидролаза, эндогликозидаза S, эндо-N-ацетил-бета-D-глюкозаминидаза, эндо-N-ацетил-бета-глюкозаминидаза, эндо-бета-N-ацетилглюкозаминидаза D, эндо-бета-N-ацетилглюкозаминидаза F, эндо-бета-N-ацетилглюкозаминидаза H, эндо-бета-N-ацетилглюкозаминидаза L, гликопептид-D-маннозил-4-N- (N-ацетил-D-глюкозаминил) 2-аспарагин 1,4-N-ацетил-бета-глюкозаминогидролаза, эндогликозидаза H) является фермент с систематическое название гликопептид-D-маннозил-N4- (N-ацетил-D-глюкозаминил) 2-аспарагин 1,4-N-ацетил-бета-глюкозаминогидролаза.[1][2][3][4][5][6] Это очень специфический эндогликозидаза который раскалывает аспарагин -связанный маннозой олигосахариды, но не сложные олигосахариды с высокой степенью переработки из гликопротеины. Он используется в исследовательских целях для дегликозилирования гликопротеинов.

Структура и деятельность

Эндогликозидаза H выделена из Streptomyces plicatus или же Streptomyces griseus.Его молекулярный вес составляет 29 000 дальтон. Первичная структура описана Роббинсом 1984.[7]

Эндогликозидаза H расщепляет связь в диацетилхитобиозном ядре теолигосахарида между двумя N-ацетилглюкозамин (GlcNAc) субъединицы непосредственно проксимальнее остатка аспарагина, образуя усеченную молекулу сахара с одним остатком N-ацетилглюкозамина, остающимся на аспарагине.[8]

Он дегликозилирует гликопротеины маннозы, но степень и скорость дегликозилирования в значительной степени зависят от природы гликопротеинов. Скорость дегликозилирования может быть увеличена денатурацией гликопротеинов (например, карбоксиметилированием, сульфитолизом или нагреванием в присутствии додецилсульфат натрия). Добавление 0,1 М 2-меркаптоэтанола сильно увеличивает активность фермента против гликопротеинов, содержащих меж- или внутримолекулярные дисульфидные мостики, в отличие от таких детергентов, как Triton X-100, н-октилглюкозид или цвиттерионных детергентов.[9]

Биохимические приложения

Эндогликозидаза H (Endo H) обычно используется клеточными биологами для мониторинга посттрансляционная модификация в аппарат Гольджи. Большинство белков, предназначенных для клеточной поверхности, являются переведено к рибосомы в грубый эндоплазматический ретикулум (ER) и переместился в Golgi. При входе в ЭР молекула, содержащая 14 субъединиц сахара, селективно связывается с аспарагином ферментом. олигосахарилтрансфераза. Именно эта молекула олигосахарида модифицируется рядом ферментов по мере того, как белок перемещается через различные отсеки аппарата Гольджи. Эндогликозидаза H способна расщеплять каждую структуру этого олигосахарида по мере ее обработки до тех пор, пока фермент Альфа-маннозидаза Гольджи II удаляет два манноза субъединицы. Поскольку все более поздние олигосахаридные структуры устойчивы к расщеплению Endo H, фермент широко используется для определения степени процессинга олигосахарида, которому подвергся интересующий белок.[10]

Рекомендации

  1. ^ Чиен С., Вайнбург Р., Ли С., Ли Ю. (1977). «Эндо-β-N-ацетилглюкозаминидаза из фигового латекса ». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 76: 317–323. Дои:10.1016 / 0006-291x (77) 90727-6.
  2. ^ Коидэ Н., Мурамацу Т. (август 1974 г.). «Эндо-бета-N-ацетилглюкозаминидаза, действующая на углеводные части гликопротеинов. Очистка и свойства фермента из Diplococcus pneumoniae». Журнал биологической химии. 249 (15): 4897–904. PMID  4152561.
  3. ^ Пирс Р. Дж., Спик Дж., Монтрей Дж. (Июнь 1979 г.). «Цитозольное расположение активности эндо-N-ацетил-бета-D-глюкозаминидазы в печени и почках крыс». Биохимический журнал. 180 (3): 673–76. Дои:10.1042 / bj1800673. ЧВК  1161109. PMID  486141.
  4. ^ Пирс Р.Дж., Спик Дж., Монтрей Дж. (Январь 1980 г.). «Демонстрация и цитозольное расположение активности эндо-N-ацетил-бета-D-глюкозаминидазы по отношению к субстрату асиало-N-ацетил-лактозаминного типа в печени крысы». Биохимический журнал. 185 (1): 261–4. Дои:10.1042 / bj1850261. ЧВК  1161293. PMID  7378051.
  5. ^ Тай Т., Ямасита К., Огата-Аракава М., Коидэ Н., Мурамацу Т., Ивашита С., Иноуэ И., Кобата А. (ноябрь 1975 г.). «Структурные исследования двух гликопептидов овальбумина в отношении специфичности эндо-бета-N-ацетилглюкозаминидазы». Журнал биологической химии. 250 (21): 8569–75. PMID  389.
  6. ^ Тарентино А.Л., Пламмер Т.Х., Мали Ф. (февраль 1974 г.). «Высвобождение интактных олигосахаридов из определенных гликопротеинов эндо-бета-N-ацетилглюкозаминидазой H». Журнал биологической химии. 249 (3): 818–24. PMID  4204553.
  7. ^ Роббинс П.В., Trimble RB, Вирт Д.Ф., Геринг К., Мали Ф., Мали Г.Ф., Дас Р., Гибсон Б.В., Роял Н., Биманн К. (июнь 1984 г.). «Первичная структура фермента Streptomyces эндо-бета-N-ацетилглюкозаминидаза H». Журнал биологической химии. 259 (12): 7577–83. PMID  6429133.
  8. ^ Эндогликозидаза H, Полярная звезда
  9. ^ Trimble RB, Maley F (сентябрь 1984 г.). «Оптимизация гидролиза N-связанных высокоманнозных олигосахаридов эндо-бета-N-ацетилглюкозаминидазой H». Аналитическая биохимия. 141 (2): 515–22. Дои:10.1016/0003-2697(84)90080-0. PMID  6437277.
  10. ^ Альбертс Б. (2002). Молекулярная биология клетки (4-е изд.). Нью-Йорк: Гарленд. ISBN  978-0-8153-4072-0.

внешняя ссылка

Близкие ферменты

Эндогликозидазы F и D, расщепляют Glc-Nac

PNGase F (Пептид-N4- (N-ацетил-бета-глюкозаминил) аспарагин_амидаза)