Факторы транскрипции GCM - GCM transcription factors
| GCM | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 структура домена gcm, связанного с ДНК | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | GCM | ||||||||
| Pfam | PF03615 | ||||||||
| Pfam клан | CL0274 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR003902 | ||||||||
| PROSITE | PS50807 | ||||||||
| SCOP2 | 1odh / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии Факторы транскрипции GCM находятся семейство белков которые содержат GCM мотив. Мотив GCM - это домен что было идентифицировано в белки принадлежащий семье регуляторы транскрипции вовлечены в фундаментальные процессы развития, которые включают Drosophila melanogaster GCM и его млекопитающее гомологи (человек GCM1 и GCM2 ).[1][2][3][4] В GCM факторы транскрипции то N-концевой фрагмент содержит ДНК -связывающий домен 150 аминокислоты. Сохранение последовательности самый высокий в этом домене GCM. Напротив, C-терминал фрагмент содержит один или два трансактивирующих участка и лишь плохо консервированный.
Было показано, что мотив GCM представляет собой ДНК-связывающий домен, который преимущественно распознает непалиндромный октамер 5'-ATGCGGGT-3 '.[1][2][3] Мотив GCM содержит много консервированный основные аминокислотные остатки, семь цистеин остатки и четыре гистидин остатки.[1] Консервативные цистеины участвуют в формировании общей конформации домена, в процессе связывания ДНК и в редокс регуляция связывания ДНК.[3] Домен GCM как новый класс Zn -содержащий ДНК-связывающий домен, не похожий на какой-либо другой ДНК-связывающий домен.[5] Домен GCM состоит из большого и малого домена, связанных вместе одним из двух Zn ионы присутствует в структура. Большой и маленький домены состоят из пяти- и трехцепочечных бета-листы соответственно с тремя маленькими спиральный сегменты упакованы на одной стороне двух бета-листы. Домен GCM реализует новый способ распознавания специфичной для последовательности ДНК, когда пятицепочечный бета-складчатый лист вставляется в большая канавка ДНК. Остатки, выступающие из краевой полосы бета-гофрированного листа, и следующие петля и прядь контактирует с базы и скелет обеих цепей ДНК, обеспечивающий специфичность для целевого сайта ДНК.
использованная литература
- ^ а б c Акияма Ю., Хосоя Т., Пул А.М., Хотта Ю. (декабрь 1996 г.). «Мотив gcm: новый ДНК-связывающий мотив, консервативный у дрозофилы и млекопитающих». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (25): 14912–6. Bibcode:1996PNAS ... 9314912A. Дои:10.1073 / пнас.93.25.14912. ЧВК 26236. PMID 8962155.
- ^ а б Schreiber J, Sock E, Wegner M (апрель 1997 г.). «Отсутствует регулятор глиальных клеток раннего глиогенеза - фактор транскрипции с новым типом ДНК-связывающего домена». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (9): 4739–44. Bibcode:1997PNAS ... 94.4739S. Дои:10.1073 / пнас.94.9.4739. ЧВК 20794. PMID 9114061.
- ^ а б c Шрайбер Дж, Эндерих Дж, Вегнер М (май 1998 г.). «Структурные требования для связывания ДНК белков GCM». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (10): 2337–43. Дои:10.1093 / nar / 26.10.2337. ЧВК 147556. PMID 9580683.
- ^ Tuerk EE, Schreiber J, Wegner M (февраль 2000 г.). «Стабильность белка и топология домена определяют транскрипционную активность глиальных клеток млекопитающих, у которых отсутствует гомолог GCMb». J. Biol. Chem. 275 (7): 4774–82. Дои:10.1074 / jbc.275.7.4774. PMID 10671510.
- ^ Коэн С.Х., Мулен М., Хашемолхоссейни С., Килиан К., Вегнер М., Мюллер К.В. (апрель 2003 г.). «Структура комплекса GCM-домен-ДНК: ДНК-связывающий домен с новой складкой и способом распознавания целевого сайта». EMBO J. 22 (8): 1835–45. Дои:10.1093 / emboj / cdg182. ЧВК 154474. PMID 12682016.