Methylophaga muralis - Methylophaga muralis

Methylophaga muralis
Научная классификация редактировать
Домен:Бактерии
Тип:Протеобактерии
Учебный класс:Гаммапротеобактерии
Заказ:Тиотрихалес
Семья:Piscirickettsiaceae
Род:Метилофага
Разновидность:
M. muralis
Биномиальное имя
Methylophaga muralis
Доронина и др., 2011[1]
Тип штамма
Kr3
ВКМ Б-2303
NCIMB 13993
Синонимы
  • Methylophaga murata Доронина и др. 2005 г.[2]

Methylophaga muralis это разновидность Протеобактерии. Он способен выжить в физиологический раствор и щелочной окружающей среде и может получить свой углерод из метанол. Этот вид был первоначально обнаружен в осыпающемся мраморе в Московский Кремль; это также было найдено в содовое озеро в Бурятия.

Таксономическая история и этимология

Этот вид был обнаружен в соскобах с разрушающихся мраморных памятников в склепах Московский Кремль.[2][3] Первоначально он назывался М. Мурата в 2005 г. описание вида к Российская Академия Наук микробиолог Юрий Александрович Троценко [RU ] и коллеги,[2] но был переименован в 2011 году в M. muralis.[1][4] В типовой штамм, Kr3, депонировался в Всероссийская коллекция микроорганизмов (VKM) и Национальная коллекция промышленных и морских бактерий (NCIMB) коллекции культур.[2]

Специфический эпитет фреска прилагательное на латинском языке, означающее «принадлежащий стене».[1][5] Его оригинальный видовой эпитет, Мурата, означает «окруженный стенами».[6]

Распространение и среда обитания

Типовой штамм Kr3 был извлечен в Москве из мрамора с pH из 9.1.[2] M. muralis является примером эндолит, имея возможность жить на скале.[7] Другой штамм, названный Bur 1, был выделен из содовое озеро в Хилганта [RU ], Бурятия, Россия.[8][9]

Бактерии растут при температуре 0–42 ° C (32–108 ° F), pH 6–11 и хлорид натрия концентрация 0,05–3 моль на литр; хотя оптимальной средой обитания является температура 20–32 ° C (68–90 ° F), pH 8–9 и концентрация хлорида натрия 0,5–1,5 моль / л. Он может выдержать нагрев до 70 ° C (158 ° F), замораживание или лиофилизированный. Поскольку этот вид адаптирован к соленой и щелочной среде, он считается одновременно галофильный и алкалифильный.[2]

Описание и биология

M. muralis клетки стержневидный, шириной 0,7 мкм и длиной 1,7–2,0 мкм. Каждая ячейка имеет жгутик на одном из его полюсов.[2]

Этот вид метилотрофный, что означает, что он может использовать углерод из одноуглеродных молекул, таких как метанол и метиламин, хотя он также получает углерод из триметиламин, и фруктоза. Это аэробный организм; помимо кислорода, ему также нужны витамин B12 и натрий ионы расти. это грамотрицательный, как все Протеобактерии. Воспроизведение осуществляется через двойное деление; это не делает споры.[2]

Его основная жирные кислоты находятся пальмитиновая кислота, пальмитолеиновая кислота, и октадекановая кислота. Главный фосфолипиды находятся фосфатидилэтаноламин, фосфатидилглицерин, и кардиолипин.[2] Эктоин, глутамат, и, в меньшей степени, сахароза вести себя как осмопротекторы.[2]

Филогения

Плимутский университет микробиолог Рич Боден, используя Модель Тамуры – Нея, утверждал на основании 16S рибосомная РНК который M. muralis, М. alcalica, и М. lonarensis сформировать клады к исключению других Метилофага виды, включая типовой вид рода, М. марина.[10] В 2013, INRS микробиолог Ричард Виллемур и его коллеги добавили свои недавно описанные виды М. nitratireducenticrescens и М. фраппьери к этой кладе также на основе анализа 16S рРНК.[11] Все виды этой клады алкалифильные.[10][11]

Рекомендации

  1. ^ а б c Euzéby, Жан, изд. (2011). «Список валидации № 138: Список новых имен и новых комбинаций, ранее эффективно, но не допустимо опубликованных». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 61 (3): 475–476. Дои:10.1099 / ijs.0.032003-0.
  2. ^ а б c d е ж грамм час я j Доронина, Н. В .; Ли, Ц. D .; Иванова, Э.Г .; Троценко, Ю. А. (2005). "Methylophaga murata sp. ноя: галоалкалифильный аэробный метилотроф из разлагающегося мрамора ». Микробиология. 74 (4): 440–447. Дои:10.1007 / s11021-005-0086-8.
  3. ^ Троценко, Ю. А .; Доронина, Н. В .; Ли, Ц. D .; Решетников, А. С. (2007). «Умеренно галогеналкалифильные аэробные метилобактерии». Микробиология. 76 (3): 253–265. Дои:10.1134 / S0026261707030010.
  4. ^ Боден, Рич (2017). «От редакции: управление - в похвалу неблагодарным задачам и уважению Wombles». Письма о микробиологии FEMS. 364 (5): fnx041. Дои:10.1093 / femsle / fnx041.
  5. ^ Льюис, Чарльтон Т .; Коротко, Чарльз (1879). "муралис". Латинский словарь. Нью-Йорк: Харпер и братья. п. 1177.
  6. ^ Glare, P. G. W .; и др., ред. (1968). «муратус». Оксфордский латинский словарь. Издательство Оксфордского университета. п. 1147.
  7. ^ Банчиу, Хория Леонард (2013). «Разнообразие эндолитических прокариот, обитающих в каменных памятниках» (PDF). Studia Universitatis Babeș-Bolyai, Biologia. 58 (1): 104–105. Дои:10.5038/1937-8602.58.1. В архиве (PDF) из оригинала от 19 ноября 2017 г.
  8. ^ Троценко Юрий А .; Шмарева Мария Н .; Доронина, Нина В .; Тарлачков, Сергей В .; Мустахимов Ильдар И .; Василенко, Олег В. (2016). "Проект последовательности генома Methylophaga muralis Бур 1, галоалкалифильный (не использующий метан) метилотроф, выделенный из содового озера ». Анонсы генома. 4 (6): e01227-16. Дои:10.1128 / геномA.01227-16.
  9. ^ Шмарева, М. Н .; Доронина, Н. В .; Тарлачков, С. В .; Василенко, О. В .; Троценко, Ю. А. (2018). "Methylophaga muralis Бур 1 - галоалкалифильный метилотроф, выделенный из содового озера Хилганта (Южное Забайкалье, Республика Бурятия) ». Микробиология. 87 (1): 33–46. Дои:10.1134 / S0026261718010162.
  10. ^ а б Боден, Рич (2011). "Исправленное описание рода Метилофага Janvier et al. 1985 ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 62 (7): 1644–1646. Дои:10.1099 / ijs.0.033639-0. PMID  21890722.
  11. ^ а б Вильнев, Селин; Мартино, Кристина; Моффри, Флориан; Виллемур, Ричард (2013). "Methylophaga nitratireducenticrescens sp. ноя и Methylophaga frappieri sp. nov., выделенный из биопленки системы денитрификации с подачей метанола, обрабатывающей морскую воду в Монреальском биодоме ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 63 (6): 2216–2222. Дои:10.1099 / ijs.0.044545-0.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение

  • Доронина, Н. В .; Торгонская, М.Л .; Федоров, Д. Н .; Троценко, Ю. А. (2015). «Аэробные метилобактерии как перспективные объекты современной биотехнологии (Обзор)». Прикладная биохимия и микробиология. 51 (2): 125–134. Дои:10.1134 / S0003683815020052.