Плакофилин-4 - Plakophilin-4

ПКП4
Идентификаторы
Псевдонимы	ПКП4, p0071, плакофилин 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 604276 MGI: 109281 ГомолоГен: 2689 Генные карты: ПКП4
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 2 (человек)
Конец	158,682,879 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	59,355,208 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание с белками; • связывание кадгерина;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • полюс шпинделя; • мембрана; • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность; • зона контакта ячейка; • межклеточное соединение; • шпиндель; • десмосома; • соединение клеток; • середина тела; • средняя зона шпинделя; • перинуклеарная область цитоплазмы; • цитоплазматическая сторона плазматической мембраны; • митотическое веретено; • цитоскелет; • ороговевший конверт; • клеточная мембрана; • ядро клетки;
Биологический процесс	• передача сигналов от клетки к клетке; • положительная регуляция цитокинеза; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase; • регуляция клеточной адгезии; • клеточная адгезия; • сборка ячейки-ячейки; • ороговение; • ороговение; • межклеточная адгезия;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8502
	227937
	ENSG00000144283
	ENSMUSG00000026991
	Q99569
	Q68FH0
NM_001005476; NM_001304969; NM_001304970; NM_001304971; NM_003628;
	NM_001377218; NM_001377219; NM_001377220; NM_001377221; NM_001377222; NM_001377223; NM_001377224; NM_001377225; NM_001377226
NM_026361; NM_175464; NM_001362990; NM_001362991; NM_001362992;
	NM_001362993; NM_001362994; NM_001362995; NM_001362996; NM_001362997; NM_001362998; NM_001362999
NP_001005476; NP_001291898; NP_001291899; NP_001291900; NP_003619;
	NP_001364147; NP_001364148; NP_001364149; NP_001364150; NP_001364151; NP_001364152; NP_001364153; NP_001364154; NP_001364155
NP_080637; NP_780673; NP_001349919; NP_001349920; NP_001349921;
	NP_001349922; NP_001349923; NP_001349924; NP_001349925; NP_001349926; NP_001349927; NP_001349928
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Плакофилин-4 это белок что у людей кодируется ПКП4 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Белки, подобные броненосцам, характеризуются серией повторов броненосцев, впервые определенных в продукте гена «броненосец» дрозофилы, которые обычно имеют длину от 42 до 45 аминокислот. Эти белки можно разделить на подсемейства на основе их количества повторов, их общего сходства последовательностей и дисперсии повторов в их последовательностях. Члены подсемейства p120 (ctn) / плакофилин армадилло-подобных белков, включая CTNND1, CTNND2, PKP1, PKP2, PKP4 и ARVCF. PKP4 может быть компонентом десмосомных бляшек и других адгезионных бляшек и, как полагают, участвует в регуляции организации соединительных бляшек и функции кадгерина. Для этого гена было обнаружено несколько вариантов транскриптов, но до сих пор описана полноразмерная природа только двух из них. Эти два варианта кодируют разные изоформы.^[7]

Взаимодействия

PKP4 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000144283 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026991 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Паффенхольц Р., Франке В.В. (декабрь 1997 г.). «Идентификация и локализация нервно экспрессируемого члена мультигенного семейства плакоглобина / броненосца». Дифференциация. 61 (5): 293–304. Дои:10.1046 / j.1432-0436.1997.6150293.x. PMID 9342840.
^ Hatzfeld M, Nachtsheim C (май 1997 г.). «Клонирование и характеристика нового члена семейства броненосцев, p0071, ассоциированного с соединительной бляшкой: свидетельство подсемейства близкородственных белков». J Cell Sci. 109 (11): 2767–78. PMID 8937994.
^ ^а ^б «Энтрез Ген: PKP4 плакофилин 4».
^ Идзава И., Нисидзава М., Томоно Ю., Отакара К., Такахаши Т., Инагаки М. (май 2002 г.). «ERBIN связывается с p0071, белком броненосца, в межклеточных соединениях эпителиальных клеток». Гены Клетки. 7 (5): 475–85. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2002.00533.x. PMID 12047349. S2CID 12598418.
^ Джаулин-Бастард Ф., Арсанто Дж. П., Ле Бивик А., Наварро С., Велли Ф, Сайто Х., Маркетто С., Хацфельд М., Сантони М. Дж., Бирнбаум Д., Борг Дж. П. (январь 2002 г.). «Взаимодействие между Эрбином и белком, связанным с катенином, в эпителиальных клетках». J. Biol. Chem. 277 (4): 2869–75. Дои:10.1074 / jbc.M109652200. PMID 11711544.
^ Лаура Р.П., Витт А.С., Хельд Х.А., Герстнер Р., Дешайес К., Кёлер М.Ф., Косик К.С., Сидху С.С., Ласки Л.А. (апрель 2002 г.). «Домен Erbin PDZ с высокой аффинностью и специфичностью связывается с карбоксильными концами дельта-катенина и ARVCF». J. Biol. Chem. 277 (15): 12906–14. Дои:10.1074 / jbc.M200818200. PMID 11821434.
^ Дегучи М., Иидзука Т., Хата Й, Нисимура В., Хирао К., Яо И., Кавабе Х., Такай Ю. (сентябрь 2000 г.). «ПАПИН. Новый множественный белок PSD-95 / Dlg-A / ZO-1, взаимодействующий с белком / дельта-катенином и p0071, связанным с нейральным плакофилином, связанным с повторением броненосца». J. Biol. Chem. 275 (38): 29875–80. Дои:10.1074 / jbc.M005384200. PMID 10896674.
^ Оно Х, Хирабаяси С., Иидзука Т., Охниши Х., Фудзита Т., Хата Й (октябрь 2002 г.). «Локализация белков, взаимодействующих с p0071, белка, взаимодействующего с белками броненосных повторов, связанных с плакофилином (PAPIN) и ERBIN, в эпителиальных клетках». Онкоген. 21 (46): 7042–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1205852. PMID 12370826.
^ Шталь Б., Дильманн А., Зюдхоф ТЦ (апрель 1999 г.). «Прямое взаимодействие пресенилина 1, связанного с болезнью Альцгеймера, с белком армадилла p0071». J. Biol. Chem. 274 (14): 9141–8. Дои:10.1074 / jbc.274.14.9141. PMID 10092585.

дальнейшее чтение

Кейл Р., Вольф А., Хюттельмайер С., Хацфельд М. (2007). «Помимо регуляции клеточной адгезии: местный контроль RhoA в борозде дробления катенином p0071». Клеточный цикл. 6 (2): 122–7. Дои:10.4161 / cc.6.2.3741. PMID 17264675.
Бонне С, ван Хенгель Дж, ван Рой Ф (1998). «Хромосомное картирование генов броненосцев человека, принадлежащих к подсемейству p120 (ctn) / плакофилин». Геномика. 51 (3): 452–4. Дои:10.1006 / geno.1998.5398. PMID 9721216.
Левеск Дж, Ю Джи, Нишимура М, Чжан Д.М., Левеск Л., Ю Х, Сюй Д., Лян Й, Рогаева Э, Икеда М., Дути М., Мурголо Н., Ван Л., Вандервере П., Бейн М.Л., Стрейдер К.Д., Ромменс Дж. М. , Fraser PE, St George-Hyslop P (1999). «Пресенилины взаимодействуют с белками броненосцев, включая нейроноспецифический белок, связанный с плакофилином, и бета-катенин». J. Neurochem. 72 (3): 999–1008. Дои:10.1046 / j.1471-4159.1999.0720999.x. PMID 10037471. S2CID 36124450.
Шталь Б., Дильманн А., Зюдхоф ТС (1999). "Прямое взаимодействие пресенилина 1, связанного с болезнью Альцгеймера, с белком броненосца p0071". J. Biol. Chem. 274 (14): 9141–8. Дои:10.1074 / jbc.274.14.9141. PMID 10092585.
Дегучи М., Иидзука Т., Хата Й, Нисимура В., Хирао К., Яо И., Кавабе Х., Такай Й. (2000). «ПАПИН. Новый множественный белок PSD-95 / Dlg-A / ZO-1, взаимодействующий с белком / дельта-катенином и p0071, связанным с нейральным плакофилином, связанным с повторением броненосца». J. Biol. Chem. 275 (38): 29875–80. Дои:10.1074 / jbc.M005384200. PMID 10896674.
Шредер Р., ван дер Вен П.Ф., Варло I, Шуман Х., Фюрст Д.О., Блюмке И., Шмидт М.С., Хацфельд М. (2001). «p0071, член мультигенного семейства броненосцев, является составной частью саркомерных I-полос в скелетных мышцах человека». J. Muscle Res. Cell. Мотил. 21 (6): 577–86. Дои:10.1023 / А: 1026587530656. PMID 11206135. S2CID 1342967.
Джаулин-Бастард Ф., Арсанто Дж. П., Ле Бивик А., Наварро С., Велли Ф, Сайто Х., Маркетто С., Хацфельд М., Сантони М. Дж., Бирнбаум Д., Борг Дж. П. (2002). «Взаимодействие между Эрбином и белком, связанным с катенином, в эпителиальных клетках». J. Biol. Chem. 277 (4): 2869–75. Дои:10.1074 / jbc.M109652200. PMID 11711544.
Идзава I, Нисидзава М., Томоно Й, Отакара К., Такахаши Т., Инагаки М. (2002). «ERBIN связывается с p0071, белком броненосца, в межклеточных соединениях эпителиальных клеток». Гены Клетки. 7 (5): 475–85. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2002.00533.x. PMID 12047349. S2CID 12598418.
Оно Х, Хирабаяси С., Иидзука Т., Охниши Х., Фудзита Т., Хата Й (2002). «Локализация белков, взаимодействующих с p0071, белка, взаимодействующего с белками броненосных повторов, связанных с плакофилином (PAPIN) и ERBIN, в эпителиальных клетках». Онкоген. 21 (46): 7042–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1205852. PMID 12370826.
Calkins CC, Hoepner BL, Law CM, Novak MR, Setzer SV, Hatzfeld M, Kowalczyk AP (2003). «Белок семейства Armadillo p0071 представляет собой VE-кадгерин- и десмоплакин-связывающий белок». J. Biol. Chem. 278 (3): 1774–83. Дои:10.1074 / jbc.M205693200. PMID 12426320.
Salomon AR, Ficarro SB, Brill LM, Brinker A, Phung QT, Ericson C, Sauer K, Brock A, Horn DM, Schultz PG, Peters EC (2003). «Профилирование путей фосфорилирования тирозина в клетках человека с помощью масс-спектрометрии». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (2): 443–8. Дои:10.1073 / pnas.2436191100. ЧВК 141014. PMID 12522270.
Hatzfeld M, Green KJ, Sauter H (2003). «Нацеливание p0071 на десмосомы и адгезивные соединения опосредуется различными белковыми доменами». J. Cell Sci. 116 (Пт 7): 1219–33. Дои:10.1242 / jcs.00275. PMID 12615965.
Сетцер С.В., Калкинс С.К., Гарнер Дж., Саммерс С., Грин К.Дж., Ковальчик А.П. (2004). «Сравнительный анализ белков семейства броненосцев в регуляции сборки, адгезии и миграции эпителиальных клеток a431». J. Invest. Дерматол. 123 (3): 426–33. Дои:10.1111 / j.0022-202X.2004.23319.x. PMID 15304078.
Чжан Ю., Вольф-Ядлин А., Росс П.Л., Паппин Д.Д., Раш Дж., Лауффенбургер Д.А., Белый FM (2005). «Масс-спектрометрия с временным разрешением сайтов фосфорилирования тирозина в сигнальной сети рецептора эпидермального фактора роста выявляет динамические модули». Мол. Cell. Протеомика. 4 (9): 1240–50. Дои:10.1074 / mcp.M500089-MCP200. PMID 15951569.
Тао В.А., Воллшайд Б., О'Брайен Р., Энг Дж. К., Ли XJ, Боденмиллер Б., Уоттс Д. Д., Худ Л., Эберсолд Р. (2005). «Количественный анализ фосфопротеома с использованием химии конъюгации дендримеров и тандемной масс-спектрометрии». Nat. Методы. 2 (8): 591–8. Дои:10.1038 / nmeth776. PMID 16094384. S2CID 20475874.
Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Эта статья о ген на хромосома 2 человека это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000144283 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026991 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9342840-5] Паффенхольц Р., Франке В.В. (декабрь 1997 г.). «Идентификация и локализация нервно экспрессируемого члена мультигенного семейства плакоглобина / броненосца». Дифференциация. 61 (5): 293–304. Дои:10.1046 / j.1432-0436.1997.6150293.x. PMID 9342840.

[pmid8937994-6] Hatzfeld M, Nachtsheim C (май 1997 г.). «Клонирование и характеристика нового члена семейства броненосцев, p0071, ассоциированного с соединительной бляшкой: свидетельство подсемейства близкородственных белков». J Cell Sci. 109 (11): 2767–78. PMID 8937994.

[entrez-7] а ^б «Энтрез Ген: PKP4 плакофилин 4».

[pmid12047349-8] Идзава И., Нисидзава М., Томоно Ю., Отакара К., Такахаши Т., Инагаки М. (май 2002 г.). «ERBIN связывается с p0071, белком броненосца, в межклеточных соединениях эпителиальных клеток». Гены Клетки. 7 (5): 475–85. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2002.00533.x. PMID 12047349. S2CID 12598418.

[pmid11711544-9] Джаулин-Бастард Ф., Арсанто Дж. П., Ле Бивик А., Наварро С., Велли Ф, Сайто Х., Маркетто С., Хацфельд М., Сантони М. Дж., Бирнбаум Д., Борг Дж. П. (январь 2002 г.). «Взаимодействие между Эрбином и белком, связанным с катенином, в эпителиальных клетках». J. Biol. Chem. 277 (4): 2869–75. Дои:10.1074 / jbc.M109652200. PMID 11711544.

[pmid11821434-10] Лаура Р.П., Витт А.С., Хельд Х.А., Герстнер Р., Дешайес К., Кёлер М.Ф., Косик К.С., Сидху С.С., Ласки Л.А. (апрель 2002 г.). «Домен Erbin PDZ с высокой аффинностью и специфичностью связывается с карбоксильными концами дельта-катенина и ARVCF». J. Biol. Chem. 277 (15): 12906–14. Дои:10.1074 / jbc.M200818200. PMID 11821434.

[pmid10896674-11] Дегучи М., Иидзука Т., Хата Й, Нисимура В., Хирао К., Яо И., Кавабе Х., Такай Ю. (сентябрь 2000 г.). «ПАПИН. Новый множественный белок PSD-95 / Dlg-A / ZO-1, взаимодействующий с белком / дельта-катенином и p0071, связанным с нейральным плакофилином, связанным с повторением броненосца». J. Biol. Chem. 275 (38): 29875–80. Дои:10.1074 / jbc.M005384200. PMID 10896674.

[pmid12370826-12] Оно Х, Хирабаяси С., Иидзука Т., Охниши Х., Фудзита Т., Хата Й (октябрь 2002 г.). «Локализация белков, взаимодействующих с p0071, белка, взаимодействующего с белками броненосных повторов, связанных с плакофилином (PAPIN) и ERBIN, в эпителиальных клетках». Онкоген. 21 (46): 7042–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1205852. PMID 12370826.

[pmid10092585-13] Шталь Б., Дильманн А., Зюдхоф ТЦ (апрель 1999 г.). «Прямое взаимодействие пресенилина 1, связанного с болезнью Альцгеймера, с белком армадилла p0071». J. Biol. Chem. 274 (14): 9141–8. Дои:10.1074 / jbc.274.14.9141. PMID 10092585.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]