Мотив РНК Rne-II - Rne-II RNA motif

rne-II РНК
Rne-II-RNA.svg
Консенсусная вторичная структура rne-II РНК
Идентификаторы
Символrne-II РНК
РфамRF01756
Прочие данные
РНК типСНГ-регулирующий элемент
Домен (ы)Pseudomonadaceae
PDB структурыPDBe

В rne-II РНК-мотив консервированный РНК структура идентифицирована с использованием биоинформатика.[1] Обнаруживается только в разновидность классифицируется в семья Pseudomonadaceae, группа гаммапротеобактерии. rne-II РНК последовательно расположены в предполагаемых 5 'непереведенные регионы (5 'UTRs) из гены что кодирует Рибонуклеаза E (РНКаза E). В Элемент RNase E 5 'UTR представляет собой ранее идентифицированную структуру РНК, которая также обнаруживается в 5 'UTR генов РНКазы E. Однако последний мотив встречается только в энтеробактерии, и два мотива, по-видимому, не связаны между собой. Принимая во внимание их различия, было высказано предположение, что rne-II РНК выполняют ту же функциональную роль, что и элементы 5 'UTR РНКазы E, которые должны регулировать уровни РНКазы E белки действуя как субстрат для РНКазы E. Таким образом, когда концентрации РНКазы E высоки, они будут разрушать свои собственные информационная РНК.

Рекомендации

  1. ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК  2864571. PMID  20230605.

внешняя ссылка