WAPAL - WAPAL - Wikipedia

WAPL
Кристаллическая структура человеческого WAPL (PDB 4K6J) .png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыWAPL, FOE, KIAA0261, WAPAL, фактор высвобождения когезина WAPL
Внешние идентификаторыOMIM: 610754 MGI: 2675859 ГомолоГен: 41002 Генные карты: WAPL
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение WAPL
Геномное расположение WAPL
Группа10q23.2Начинать86,435,256 бп[1]
Конец86,521,792 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE WAPAL 212267 в формате fs.png

PBB GE WAPAL 212264 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_015045
NM_001318328

NM_001004436
NM_001301330

RefSeq (белок)

NP_001305257
NP_055860

NP_001004436
NP_001288259

Расположение (UCSC)Chr 10: 86,44 - 86,52 МбChr 14: 34,67 - 34,75 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гомолог белка, похожего на крылья (WAPL) это белок что у людей кодируется WAPAL ген.[5][6][7] WAPL - ключевой регулятор Cohesin комплекс, который опосредует сцепление сестринских хроматид, гомологичная рекомбинация и Зацикливание ДНК. Cohesin состоит из SMC3, SMC1, RAD21 и либо SA1 или же SA2. [8] Cohesin имеет кольцевое расположение, и считается, что он связан с хромосомой, захватывая ее в виде петли ДНК, одной нити или пары сестринских хромосом. WAPL образует комплекс с PDS5A или же PDS5B и высвобождает когезин из ДНК, открывая интерфейс между SMC3 и RAD21.

Межфазный

Структура PDS5B (синий), WAPL (зеленый) и IP6 (PDB 5HDT) (Ouyang et al., 2016)

Загрузка когезина начинается в телофазе и опосредуется НИПБЛ и его связывающий партнер MAU2. В G1, WAPL образует комплекс с PDS5 и удаляет когезин из ДНК, но он перезагружается с помощью NIPBL-MAU2. Равновесие между загрузкой и высвобождением дает когезину время пребывания ДНК 20 минут. Во время репликации ДНК часть когезина ацетилируется и связывается с Сорорин что делает его устойчивым к WAPL и способным удерживать сестринские хроматиды вместе. Это критически важно для поддержания слипчивости сестринских хроматид, потому что на этом сестринские хроматиды разделены, слипчивость не может быть восстановлена.

Профазный путь

Когда клетка входит в митоз, сорорин фосфорилируется, вызывая диссоциацию его от когезина, что означает, что WAPL может удалить когезин из ДНК. Комплекс SGOL1 и PP2A дефосфорилирует когезин в центромере, защищая его от WAPL-опосредованного высвобождения. Сцепление сестринских хроматид, таким образом, сохраняется в центромерах, где оно необходимо для митоза, но теряется на плечах. Это удаление когезина известно как профазный путь и приводит к появлению сестринских хроматид Х-образной формы, наблюдаемых в разбросах хромосом.

Механизм

WAPL высвобождает когезин из ДНК, открывая интерфейс SMC3-RAD21, тем самым позволяя ДНК выходить из кольца.[9] Открытие этого интерфейса регулируется АТФ-связыванием субъединицами SMC. Это вызывает димеризацию головных доменов АТФазы и деформирует спиральную спираль SMC3, тем самым нарушая связывание RAD21 со спиральной спиралью.[10] Неизвестно, как WAPL регулирует процесс связывания АТФ.

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000062650 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041408 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Охира М., Каварабаяси И., Охара О. и др. (Октябрь 1996 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VI. Кодирующие последовательности 80 новых генов (KIAA0201-KIAA0280), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток KG-1 и мозга». ДНК исследования. 3 (5): 321–9, 341–54. Дои:10.1093 / днарес / 3.5.321. PMID  9039502.
  6. ^ Ганди Р., Гиллеспи П. Дж., Хирано Т. (декабрь 2006 г.). «Человеческий Wapl - это когезин-связывающий белок, который способствует разрешению сестринских хроматид в митотической профазе». Текущая биология. 16 (24): 2406–17. Дои:10.1016 / j.cub.2006.10.061. ЧВК  1850625. PMID  17112726.
  7. ^ «Entrez Gene: WAPAL-крылья, похожие на обособленные гомологи (Drosophila)».
  8. ^ Яцкевич С., Родос Дж., Нэсмит К. (декабрь 2019 г.). «Организация хромосомной ДНК комплексами SMC». Ежегодный обзор генетики. 53: 445–482. Дои:10.1146 / annurev-genet-112618-043633. PMID  31577909.
  9. ^ Beckouët F, Srinivasan M, Roig MB, Chan KL, Scheinost JC, Batty P и др. (Февраль 2016). «Освобождение деятельности отключает интерфейс Cohesin Smc3 / Scc1 в процессе, заблокированном ацетилированием». Молекулярная клетка. 61 (4): 563–574. Дои:10.1016 / j.molcel.2016.01.026. ЧВК  4769318. PMID  26895425.
  10. ^ Мюир К.В., Ли И, Вайс Ф, Панне Д. (март 2020 г.). «Структура когезин-АТФазы объясняет механизм раскрытия SMC-клейзинового кольца». Структурная и молекулярная биология природы. 27 (3): 233–239. Дои:10.1038 / с41594-020-0379-7. ЧВК  7100847. PMID  32066964.