Белковый домен YTH - YTH protein domain
| Белковый домен YTH | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | YTH | ||||||||
| Pfam | PF04146 | ||||||||
| Pfam клан | CL0178 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR007275 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии белковый домен, YTH относится к члену семейства YTH, который, как было показано, выборочно удаляет стенограммы из мейоз -специфический гены выразил в митотический клетки.[1]
Этот белковый домен, YTH-домен, является консервированный по всему эукариоты и предполагает, что консервированный С-концевой регион играет важную роль в передаче цитозольный Са-сигналы к ядро, тем самым регулируя экспрессия гена.[2]
Функция / механизм
Было высказано предположение, что в более высоких эукариотический Члены семейства YTH могут участвовать в аналогичных механизмах подавления генная регуляция во время гаметогенеза или общего молчания. В крыса белок YT521-B, SWISSPROT, представляет собой фосфорилированный тирозином ядерный белок, который взаимодействует с ядерным транскриптосомным компонентом каркаса вложение фактор B и 68 кДа Src субстрат связаны во время митоз, Sam68. В естественных условиях сращивание анализы продемонстрировали, что YT521-B модулирует альтернативные сайт сращивания отбор в зависимости от концентрации.[3] Кроме того, также считается, что домен YTH играет роль в связывании РНК. [4]
Структура
Предполагается, что домен будет смешанным альфа / бета-кратным, содержащим четыре альфа спирали и шесть бета-нити.[4]
Растение
В растение клетки экологические стимулы, которые свет, патогены, гормоны, и абиотический стрессы, вызывают изменения в цитозольный уровни кальция, но мало что известно о пути передачи Са-сигналов в цитозольном ядре; куда генная регуляция происходит, чтобы должным образом реагировать на стресс. Было продемонстрировано, что два романа Арабидопсис Талиана (Мышиный кресс-салат) белки, (ECT1 и ECT2), особенно связанные с Кальциневрин Взаимодействующая с B-подобным протеинкиназа1 (CIPK1), член Ser / Thr протеинкиназы который взаимодействовать с кальциневрином B-подобным Ca-связывающим белки. Эти два белка содержат очень похожую С-концевую область (180 аминокислоты по длине, сходство 81%), что необходимо и достаточно для взаимодействия с CIPK1 и перемещение к ядро.
Рекомендации
- ^ Харигая Й., Танака Х., Яманака С., Танака К., Ватанабэ Й., Цуцуми С., Чикашиге Й., Хираока Й., Ямасита А., Ямамото М. (июль 2006 г.). «Избирательное удаление матричной РНК предотвращает преждевременный мейоз». Природа. 442 (7098): 45–50. Дои:10.1038 / природа04881. PMID 16823445. S2CID 4383571.
- ^ Ok SH, Jeong HJ, Bae JM, Shin JS, Luan S, Kim KN (сентябрь 2005 г.). «Новые белки, ассоциированные с CIPK1, в Arabidopsis содержат эволюционно консервативную С-концевую область, которая опосредует ядерную локализацию». Физиология растений. 139 (1): 138–50. Дои:10.1104 / стр.105.065649. ЧВК 1203364. PMID 16113215.
- ^ Hartmann AM, Nayler O, Schwaiger FW, Obermeier A, Stamm S (ноябрь 1999 г.). «Взаимодействие и совместная локализация Sam68 со связанным со сплайсингом фактором YT521-B в ядерных точках регулируется киназой семейства Src p59 (fyn)». Мол. Биол. Клетка. 10 (11): 3909–26. Дои:10.1091 / mbc.10.11.3909. ЧВК 25688. PMID 10564280.
- ^ а б Стоилов П., Рафальская И., Штамм С. (октябрь 2002 г.). «YTH: новый домен в ядерных белках». Trends Biochem. Наука. 27 (10): 495–7. Дои:10.1016 / S0968-0004 (02) 02189-8. PMID 12368078.